L'Alliance en proie à une nouvelle faction en la présence de l'Alliance Obscure, leurs flottes déjà éparpillées afin de maintenir les frontières face à l'empire Sith,  elle doit à présent obtenir des informations quant au plan de leur nouvel ennemi. Placer leur force au mauvais endroit pourrait provoquer un effet boule de neige. C'est pourquoi l'Ordre Jedi doit réussir à infiltrer le coeur de l'Alliance obscure afin de récolter des données quant à leur force, mais égaleemnt quant à leur plan d'action...